Sebbene le prime notizie certe dell'attuale Capranica si collocano a partite dall'anno 1050 i primi Insediamenti nei territori di capranica risalgono all'epoca degli Etruschi. Posta sotto la giurisdizione del convento sutrino dei SS. Cosma e Damiano fu a partire dal 1300, con la famiglia Anguillara, che inizio a svilupparsi come centro indipendente.

Passata nelle mani degli Orsini capranica inizio a sviluppare la sua influenza sui territori circostanti tanto da essere coinvolta nella guerra che i Conti combatterono contro i Prefetti di Vico per tutto il XIV secolo. Nel 1435 il conte Everso combattè a fianco di Papa Eugenio IV per cacciare l'ultimo prefetto Giacomo di Vico e i suoi due figli Menelao e Securanza. Deifobo e Francesco, successori del Conte Everso, a seguito degli scontri con papa Paolo II provocarono la caduta degli Anguillara il 7 luglio 1465.

Papa Paolo II donò a Capranica un cardinale governatore che fece del borgo il capoluogo del governatorato. Prima del 1700 in questo periodo, sotto la guida dei cardinali, il paese venne ampliato e furono costruiti i palazzi più importanti.

Nel 1831 Papa Leone XII tolse a Capranica il titolo di capoluogo. Durante la Seconda guerra mondiale fu più volte colpita dalle bombe.